Protein–RNA interactions for Protein: Q08642

Padi2, Protein-arginine deiminase type-2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi2Q08642 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Padi2Q08642 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Padi2Q08642 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Padi2Q08642 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Padi2Q08642 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Padi2Q08642 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Padi2Q08642 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Padi2Q08642 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Padi2Q08642 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Padi2Q08642 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Padi2Q08642 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Padi2Q08642 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Padi2Q08642 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Padi2Q08642 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Padi2Q08642 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms