Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RelbQ04863 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RelbQ04863 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RelbQ04863 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RelbQ04863 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RelbQ04863 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RelbQ04863 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RelbQ04863 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RelbQ04863 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RelbQ04863 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RelbQ04863 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RelbQ04863 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RelbQ04863 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RelbQ04863 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RelbQ04863 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RelbQ04863 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelbQ04863 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelbQ04863 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RelbQ04863 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RelbQ04863 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RelbQ04863 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RelbQ04863 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RelbQ04863 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RelbQ04863 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RelbQ04863 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RelbQ04863 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RelbQ04863 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RelbQ04863 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RelbQ04863 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RelbQ04863 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelbQ04863 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelbQ04863 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelbQ04863 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelbQ04863 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelbQ04863 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RelbQ04863 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RelbQ04863 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RelbQ04863 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RelbQ04863 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RelbQ04863 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RelbQ04863 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RelbQ04863 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RelbQ04863 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RelbQ04863 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelbQ04863 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelbQ04863 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RelbQ04863 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RelbQ04863 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RelbQ04863 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RelbQ04863 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RelbQ04863 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RelbQ04863 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RelbQ04863 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms