Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SelpQ01102 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SelpQ01102 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SelpQ01102 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SelpQ01102 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SelpQ01102 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SelpQ01102 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SelpQ01102 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SelpQ01102 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SelpQ01102 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SelpQ01102 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SelpQ01102 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SelpQ01102 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SelpQ01102 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SelpQ01102 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SelpQ01102 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SelpQ01102 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SelpQ01102 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SelpQ01102 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SelpQ01102 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SelpQ01102 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SelpQ01102 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SelpQ01102 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SelpQ01102 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SelpQ01102 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SelpQ01102 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SelpQ01102 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SelpQ01102 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SelpQ01102 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SelpQ01102 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SelpQ01102 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SelpQ01102 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SelpQ01102 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SelpQ01102 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SelpQ01102 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SelpQ01102 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SelpQ01102 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SelpQ01102 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SelpQ01102 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SelpQ01102 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SelpQ01102 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SelpQ01102 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SelpQ01102 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SelpQ01102 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SelpQ01102 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SelpQ01102 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SelpQ01102 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SelpQ01102 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SelpQ01102 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SelpQ01102 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SelpQ01102 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SelpQ01102 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SelpQ01102 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SelpQ01102 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SelpQ01102 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SelpQ01102 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SelpQ01102 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SelpQ01102 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SelpQ01102 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SelpQ01102 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SelpQ01102 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SelpQ01102 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SelpQ01102 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SelpQ01102 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SelpQ01102 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SelpQ01102 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SelpQ01102 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SelpQ01102 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SelpQ01102 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SelpQ01102 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SelpQ01102 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SelpQ01102 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SelpQ01102 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SelpQ01102 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SelpQ01102 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SelpQ01102 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SelpQ01102 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SelpQ01102 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SelpQ01102 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SelpQ01102 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1695.2 ms