Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VldlrP98156 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VldlrP98156 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VldlrP98156 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VldlrP98156 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VldlrP98156 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VldlrP98156 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VldlrP98156 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VldlrP98156 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VldlrP98156 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VldlrP98156 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VldlrP98156 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VldlrP98156 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VldlrP98156 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VldlrP98156 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VldlrP98156 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VldlrP98156 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VldlrP98156 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VldlrP98156 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms