Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-Q6P79568 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-Q6P79568 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Q6P79568 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Q6P79568 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q6P79568 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q6P79568 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q6P79568 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2-Q6P79568 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms