Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb6P70689 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gjb6P70689 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjb6P70689 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb6P70689 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb6P70689 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb6P70689 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjb6P70689 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjb6P70689 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjb6P70689 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb6P70689 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb6P70689 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb6P70689 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb6P70689 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb6P70689 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjb6P70689 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gjb6P70689 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gjb6P70689 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gjb6P70689 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gjb6P70689 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gjb6P70689 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gjb6P70689 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gjb6P70689 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gjb6P70689 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjb6P70689 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gjb6P70689 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms