Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcr4P70658 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcr4P70658 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cxcr4P70658 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcr4P70658 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcr4P70658 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms