Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smad1P70340 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smad1P70340 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smad1P70340 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smad1P70340 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smad1P70340 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smad1P70340 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smad1P70340 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smad1P70340 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad1P70340 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad1P70340 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad1P70340 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad1P70340 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smad1P70340 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smad1P70340 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smad1P70340 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smad1P70340 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smad1P70340 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smad1P70340 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smad1P70340 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smad1P70340 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smad1P70340 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad1P70340 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad1P70340 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad1P70340 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smad1P70340 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smad1P70340 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad1P70340 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad1P70340 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad1P70340 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smad1P70340 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smad1P70340 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smad1P70340 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad1P70340 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad1P70340 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smad1P70340 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smad1P70340 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smad1P70340 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smad1P70340 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smad1P70340 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smad1P70340 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smad1P70340 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smad1P70340 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smad1P70340 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smad1P70340 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smad1P70340 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smad1P70340 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smad1P70340 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smad1P70340 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smad1P70340 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smad1P70340 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad1P70340 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad1P70340 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smad1P70340 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smad1P70340 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad1P70340 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad1P70340 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad1P70340 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad1P70340 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad1P70340 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smad1P70340 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smad1P70340 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smad1P70340 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad1P70340 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad1P70340 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad1P70340 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad1P70340 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad1P70340 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smad1P70340 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms