Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NficP70255 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NficP70255 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NficP70255 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NficP70255 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NficP70255 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NficP70255 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NficP70255 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NficP70255 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NficP70255 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NficP70255 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NficP70255 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NficP70255 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NficP70255 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NficP70255 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NficP70255 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NficP70255 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NficP70255 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NficP70255 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NficP70255 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NficP70255 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NficP70255 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NficP70255 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NficP70255 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NficP70255 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NficP70255 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NficP70255 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NficP70255 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NficP70255 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NficP70255 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NficP70255 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NficP70255 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NficP70255 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NficP70255 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NficP70255 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NficP70255 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NficP70255 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NficP70255 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NficP70255 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NficP70255 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NficP70255 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NficP70255 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NficP70255 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NficP70255 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NficP70255 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NficP70255 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NficP70255 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NficP70255 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NficP70255 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NficP70255 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NficP70255 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NficP70255 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NficP70255 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NficP70255 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NficP70255 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NficP70255 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NficP70255 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NficP70255 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NficP70255 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NficP70255 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NficP70255 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NficP70255 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NficP70255 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NficP70255 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NficP70255 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NficP70255 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NficP70255 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NficP70255 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NficP70255 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NficP70255 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NficP70255 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NficP70255 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NficP70255 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NficP70255 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NficP70255 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NficP70255 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NficP70255 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NficP70255 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NficP70255 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NficP70255 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NficP70255 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NficP70255 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NficP70255 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NficP70255 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NficP70255 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NficP70255 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NficP70255 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NficP70255 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NficP70255 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NficP70255 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NficP70255 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NficP70255 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NficP70255 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NficP70255 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NficP70255 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NficP70255 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NficP70255 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NficP70255 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NficP70255 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NficP70255 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms