Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms