Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf13P61216 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf13P61216 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf13P61216 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf13P61216 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf13P61216 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf13P61216 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf13P61216 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf13P61216 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf13P61216 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf13P61216 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf13P61216 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf13P61216 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf13P61216 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf13P61216 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf13P61216 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf13P61216 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf13P61216 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf13P61216 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf13P61216 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf13P61216 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf13P61216 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Taf13P61216 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf13P61216 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf13P61216 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf13P61216 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf13P61216 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf13P61216 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf13P61216 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms