Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rce1P57791 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rce1P57791 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rce1P57791 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rce1P57791 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rce1P57791 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rce1P57791 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rce1P57791 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rce1P57791 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rce1P57791 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rce1P57791 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rce1P57791 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rce1P57791 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rce1P57791 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rce1P57791 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rce1P57791 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rce1P57791 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rce1P57791 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rce1P57791 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rce1P57791 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rce1P57791 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rce1P57791 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rce1P57791 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rce1P57791 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rce1P57791 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms