Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CdaP56389 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CdaP56389 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CdaP56389 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CdaP56389 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CdaP56389 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CdaP56389 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CdaP56389 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CdaP56389 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CdaP56389 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CdaP56389 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CdaP56389 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CdaP56389 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CdaP56389 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CdaP56389 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CdaP56389 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CdaP56389 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CdaP56389 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CdaP56389 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CdaP56389 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CdaP56389 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CdaP56389 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CdaP56389 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CdaP56389 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CdaP56389 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CdaP56389 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CdaP56389 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CdaP56389 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CdaP56389 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CdaP56389 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CdaP56389 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CdaP56389 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CdaP56389 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CdaP56389 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CdaP56389 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CdaP56389 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CdaP56389 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CdaP56389 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CdaP56389 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CdaP56389 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CdaP56389 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CdaP56389 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CdaP56389 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CdaP56389 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CdaP56389 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CdaP56389 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CdaP56389 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CdaP56389 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CdaP56389 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CdaP56389 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CdaP56389 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CdaP56389 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CdaP56389 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CdaP56389 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CdaP56389 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CdaP56389 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CdaP56389 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CdaP56389 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CdaP56389 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CdaP56389 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CdaP56389 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CdaP56389 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CdaP56389 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CdaP56389 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CdaP56389 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CdaP56389 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CdaP56389 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CdaP56389 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CdaP56389 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CdaP56389 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CdaP56389 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CdaP56389 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CdaP56389 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CdaP56389 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CdaP56389 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CdaP56389 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CdaP56389 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CdaP56389 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CdaP56389 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CdaP56389 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CdaP56389 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CdaP56389 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CdaP56389 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CdaP56389 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CdaP56389 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CdaP56389 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CdaP56389 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CdaP56389 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CdaP56389 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CdaP56389 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CdaP56389 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CdaP56389 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CdaP56389 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CdaP56389 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CdaP56389 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CdaP56389 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CdaP56389 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CdaP56389 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CdaP56389 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CdaP56389 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms