Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
GastP48757 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,28■■□□□ 1
GastP48757 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21,28■■□□□ 1
GastP48757 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
GastP48757 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21,27■■□□□ 1
GastP48757 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
GastP48757 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
GastP48757 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
GastP48757 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21,26■□□□□ 0,99
GastP48757 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21,26■□□□□ 0,99
GastP48757 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
GastP48757 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
GastP48757 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
GastP48757 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
GastP48757 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
GastP48757 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21,24■□□□□ 0,99
GastP48757 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
GastP48757 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
GastP48757 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
GastP48757 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
GastP48757 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,22■□□□□ 0,99
GastP48757 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
GastP48757 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
GastP48757 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
GastP48757 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
GastP48757 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
GastP48757 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
GastP48757 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
GastP48757 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
GastP48757 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,19■□□□□ 0,98
GastP48757 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21,19■□□□□ 0,98
GastP48757 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
GastP48757 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
GastP48757 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
GastP48757 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,18■□□□□ 0,98
GastP48757 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
GastP48757 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
GastP48757 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
GastP48757 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
GastP48757 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
GastP48757 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21,16■□□□□ 0,98
GastP48757 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
GastP48757 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
GastP48757 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
GastP48757 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
GastP48757 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,12■□□□□ 0,97
GastP48757 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
GastP48757 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21,1■□□□□ 0,97
GastP48757 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
GastP48757 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
GastP48757 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
GastP48757 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
GastP48757 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
GastP48757 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
GastP48757 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
GastP48757 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
GastP48757 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
GastP48757 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21,08■□□□□ 0,97
GastP48757 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
GastP48757 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
GastP48757 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
GastP48757 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21,07■□□□□ 0,96
GastP48757 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21,06■□□□□ 0,96
GastP48757 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
GastP48757 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
GastP48757 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
GastP48757 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
GastP48757 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
GastP48757 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
GastP48757 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21,05■□□□□ 0,96
GastP48757 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
GastP48757 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
GastP48757 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
GastP48757 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,04■□□□□ 0,96
GastP48757 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
GastP48757 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
GastP48757 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
GastP48757 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
GastP48757 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
GastP48757 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,02■□□□□ 0,96
GastP48757 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
GastP48757 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,02■□□□□ 0,96
GastP48757 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
GastP48757 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
GastP48757 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
GastP48757 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
GastP48757 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
GastP48757 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
GastP48757 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20,98■□□□□ 0,95
GastP48757 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
GastP48757 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
GastP48757 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
GastP48757 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
GastP48757 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
GastP48757 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
GastP48757 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
GastP48757 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
GastP48757 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
GastP48757 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20,93■□□□□ 0,94
GastP48757 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,2 ms