Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GastP48757 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GastP48757 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GastP48757 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GastP48757 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GastP48757 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GastP48757 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GastP48757 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GastP48757 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GastP48757 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GastP48757 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GastP48757 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GastP48757 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GastP48757 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GastP48757 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GastP48757 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GastP48757 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GastP48757 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GastP48757 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GastP48757 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GastP48757 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GastP48757 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GastP48757 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GastP48757 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GastP48757 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GastP48757 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GastP48757 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GastP48757 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GastP48757 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GastP48757 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GastP48757 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GastP48757 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GastP48757 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GastP48757 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GastP48757 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GastP48757 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GastP48757 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GastP48757 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GastP48757 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GastP48757 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GastP48757 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GastP48757 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GastP48757 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GastP48757 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GastP48757 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GastP48757 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GastP48757 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GastP48757 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GastP48757 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GastP48757 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GastP48757 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GastP48757 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GastP48757 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GastP48757 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GastP48757 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GastP48757 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GastP48757 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GastP48757 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GastP48757 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GastP48757 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GastP48757 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GastP48757 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GastP48757 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GastP48757 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GastP48757 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GastP48757 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GastP48757 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GastP48757 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GastP48757 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GastP48757 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GastP48757 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GastP48757 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GastP48757 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GastP48757 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GastP48757 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GastP48757 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GastP48757 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GastP48757 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GastP48757 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GastP48757 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GastP48757 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GastP48757 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GastP48757 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GastP48757 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GastP48757 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GastP48757 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GastP48757 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GastP48757 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GastP48757 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GastP48757 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GastP48757 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GastP48757 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GastP48757 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GastP48757 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GastP48757 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GastP48757 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GastP48757 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GastP48757 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GastP48757 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GastP48757 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 736.5 ms