Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
GdnfP48540 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21,02■□□□□ 0,96
GdnfP48540 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,99■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20,99■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,99■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
GdnfP48540 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20,93■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20,91■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20,91■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20,9■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
GdnfP48540 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20,9■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
GdnfP48540 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
GdnfP48540 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20,88■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20,88■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
GdnfP48540 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20,87■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20,87■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
GdnfP48540 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20,85■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
GdnfP48540 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
GdnfP48540 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,92
GdnfP48540 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
GdnfP48540 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
GdnfP48540 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
GdnfP48540 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
GdnfP48540 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
GdnfP48540 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
GdnfP48540 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
GdnfP48540 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20,78■□□□□ 0,92
GdnfP48540 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
GdnfP48540 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
GdnfP48540 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
GdnfP48540 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
GdnfP48540 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
GdnfP48540 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20,77■□□□□ 0,92
GdnfP48540 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20,75■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,74■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
GdnfP48540 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
GdnfP48540 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20,73■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
GdnfP48540 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20,7■□□□□ 0,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48,7 ms