Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VdrP48281 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VdrP48281 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VdrP48281 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VdrP48281 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VdrP48281 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VdrP48281 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VdrP48281 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VdrP48281 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VdrP48281 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VdrP48281 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VdrP48281 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VdrP48281 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VdrP48281 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VdrP48281 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VdrP48281 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VdrP48281 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VdrP48281 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VdrP48281 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VdrP48281 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VdrP48281 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VdrP48281 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VdrP48281 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VdrP48281 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VdrP48281 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VdrP48281 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VdrP48281 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VdrP48281 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VdrP48281 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VdrP48281 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VdrP48281 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VdrP48281 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VdrP48281 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VdrP48281 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VdrP48281 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VdrP48281 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VdrP48281 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VdrP48281 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VdrP48281 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VdrP48281 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VdrP48281 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VdrP48281 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VdrP48281 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VdrP48281 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VdrP48281 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VdrP48281 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VdrP48281 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VdrP48281 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VdrP48281 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VdrP48281 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VdrP48281 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VdrP48281 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VdrP48281 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VdrP48281 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VdrP48281 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VdrP48281 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VdrP48281 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VdrP48281 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VdrP48281 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VdrP48281 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VdrP48281 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VdrP48281 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VdrP48281 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VdrP48281 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VdrP48281 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VdrP48281 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VdrP48281 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VdrP48281 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VdrP48281 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VdrP48281 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VdrP48281 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VdrP48281 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VdrP48281 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VdrP48281 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VdrP48281 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VdrP48281 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VdrP48281 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VdrP48281 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VdrP48281 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VdrP48281 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VdrP48281 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VdrP48281 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VdrP48281 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VdrP48281 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VdrP48281 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VdrP48281 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VdrP48281 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VdrP48281 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VdrP48281 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VdrP48281 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VdrP48281 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VdrP48281 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VdrP48281 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VdrP48281 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VdrP48281 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VdrP48281 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VdrP48281 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VdrP48281 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VdrP48281 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VdrP48281 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms