Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Resp18P47939 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Resp18P47939 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Resp18P47939 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Resp18P47939 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Resp18P47939 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Resp18P47939 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Resp18P47939 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Resp18P47939 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Resp18P47939 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Resp18P47939 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Resp18P47939 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Resp18P47939 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Resp18P47939 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Resp18P47939 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Resp18P47939 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Resp18P47939 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Resp18P47939 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Resp18P47939 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Resp18P47939 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Resp18P47939 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Resp18P47939 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Resp18P47939 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Resp18P47939 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Resp18P47939 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Resp18P47939 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Resp18P47939 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Resp18P47939 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Resp18P47939 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Resp18P47939 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Resp18P47939 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Resp18P47939 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Resp18P47939 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Resp18P47939 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Resp18P47939 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Resp18P47939 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Resp18P47939 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Resp18P47939 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Resp18P47939 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Resp18P47939 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Resp18P47939 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Resp18P47939 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Resp18P47939 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Resp18P47939 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Resp18P47939 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Resp18P47939 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Resp18P47939 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Resp18P47939 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Resp18P47939 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Resp18P47939 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Resp18P47939 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Resp18P47939 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Resp18P47939 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Resp18P47939 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Resp18P47939 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Resp18P47939 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Resp18P47939 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Resp18P47939 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Resp18P47939 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Resp18P47939 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Resp18P47939 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Resp18P47939 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Resp18P47939 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Resp18P47939 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Resp18P47939 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Resp18P47939 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Resp18P47939 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Resp18P47939 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Resp18P47939 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Resp18P47939 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms