Protein–RNA interactions for Protein: P47879

Igfbp4, Insulin-like growth factor-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp4P47879 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igfbp4P47879 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igfbp4P47879 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igfbp4P47879 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igfbp4P47879 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Igfbp4P47879 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Igfbp4P47879 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Igfbp4P47879 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Igfbp4P47879 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Igfbp4P47879 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Igfbp4P47879 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Igfbp4P47879 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Igfbp4P47879 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Igfbp4P47879 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Igfbp4P47879 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Igfbp4P47879 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Igfbp4P47879 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Igfbp4P47879 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Igfbp4P47879 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Igfbp4P47879 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Igfbp4P47879 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Igfbp4P47879 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Igfbp4P47879 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Igfbp4P47879 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Igfbp4P47879 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Igfbp4P47879 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Igfbp4P47879 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Igfbp4P47879 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Igfbp4P47879 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Igfbp4P47879 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Igfbp4P47879 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Igfbp4P47879 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Igfbp4P47879 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Igfbp4P47879 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Igfbp4P47879 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Igfbp4P47879 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Igfbp4P47879 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Igfbp4P47879 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Igfbp4P47879 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Igfbp4P47879 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Igfbp4P47879 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Igfbp4P47879 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Igfbp4P47879 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Igfbp4P47879 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Igfbp4P47879 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Igfbp4P47879 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Igfbp4P47879 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Igfbp4P47879 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Igfbp4P47879 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Igfbp4P47879 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Igfbp4P47879 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Igfbp4P47879 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Igfbp4P47879 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Igfbp4P47879 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Igfbp4P47879 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Igfbp4P47879 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Igfbp4P47879 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Igfbp4P47879 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Igfbp4P47879 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Igfbp4P47879 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Igfbp4P47879 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Igfbp4P47879 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Igfbp4P47879 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Igfbp4P47879 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Igfbp4P47879 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Igfbp4P47879 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Igfbp4P47879 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Igfbp4P47879 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Igfbp4P47879 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Igfbp4P47879 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Igfbp4P47879 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Igfbp4P47879 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Igfbp4P47879 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Igfbp4P47879 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Igfbp4P47879 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Igfbp4P47879 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Igfbp4P47879 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Igfbp4P47879 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Igfbp4P47879 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Igfbp4P47879 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms