Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VhlP40338 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VhlP40338 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VhlP40338 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VhlP40338 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VhlP40338 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VhlP40338 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VhlP40338 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VhlP40338 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VhlP40338 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VhlP40338 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VhlP40338 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VhlP40338 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VhlP40338 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VhlP40338 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VhlP40338 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VhlP40338 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VhlP40338 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VhlP40338 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VhlP40338 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VhlP40338 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VhlP40338 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VhlP40338 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VhlP40338 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VhlP40338 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VhlP40338 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VhlP40338 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VhlP40338 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
VhlP40338 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VhlP40338 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VhlP40338 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VhlP40338 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VhlP40338 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VhlP40338 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VhlP40338 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VhlP40338 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VhlP40338 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VhlP40338 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VhlP40338 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VhlP40338 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VhlP40338 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VhlP40338 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VhlP40338 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VhlP40338 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VhlP40338 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VhlP40338 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VhlP40338 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VhlP40338 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VhlP40338 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VhlP40338 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VhlP40338 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VhlP40338 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VhlP40338 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VhlP40338 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VhlP40338 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VhlP40338 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VhlP40338 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VhlP40338 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VhlP40338 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VhlP40338 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VhlP40338 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VhlP40338 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VhlP40338 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VhlP40338 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VhlP40338 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VhlP40338 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VhlP40338 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VhlP40338 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VhlP40338 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VhlP40338 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VhlP40338 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VhlP40338 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VhlP40338 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VhlP40338 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VhlP40338 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VhlP40338 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VhlP40338 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VhlP40338 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VhlP40338 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VhlP40338 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VhlP40338 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VhlP40338 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VhlP40338 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VhlP40338 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VhlP40338 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VhlP40338 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VhlP40338 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VhlP40338 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VhlP40338 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VhlP40338 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VhlP40338 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VhlP40338 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VhlP40338 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VhlP40338 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VhlP40338 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VhlP40338 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VhlP40338 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VhlP40338 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VhlP40338 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VhlP40338 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms