Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Chd1P40201 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
Chd1P40201 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Chd1P40201 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Chd1P40201 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Chd1P40201 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Chd1P40201 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Chd1P40201 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Chd1P40201 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Chd1P40201 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Chd1P40201 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Chd1P40201 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Chd1P40201 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Chd1P40201 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Chd1P40201 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Chd1P40201 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Chd1P40201 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Chd1P40201 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Chd1P40201 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Chd1P40201 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
Chd1P40201 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Chd1P40201 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Chd1P40201 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Chd1P40201 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Chd1P40201 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Chd1P40201 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Chd1P40201 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Chd1P40201 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Chd1P40201 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Chd1P40201 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Chd1P40201 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Chd1P40201 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Chd1P40201 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Chd1P40201 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Chd1P40201 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Chd1P40201 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Chd1P40201 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Chd1P40201 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Chd1P40201 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Chd1P40201 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Chd1P40201 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Chd1P40201 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Chd1P40201 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Chd1P40201 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Chd1P40201 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Chd1P40201 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Chd1P40201 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Chd1P40201 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Chd1P40201 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Chd1P40201 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Chd1P40201 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Chd1P40201 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Chd1P40201 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Chd1P40201 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Chd1P40201 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Chd1P40201 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Chd1P40201 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Chd1P40201 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Chd1P40201 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Chd1P40201 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Chd1P40201 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Chd1P40201 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Chd1P40201 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Chd1P40201 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Chd1P40201 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Chd1P40201 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Chd1P40201 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Chd1P40201 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Chd1P40201 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Chd1P40201 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Chd1P40201 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Chd1P40201 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Chd1P40201 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Chd1P40201 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Chd1P40201 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Chd1P40201 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Chd1P40201 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Chd1P40201 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Chd1P40201 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Chd1P40201 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Chd1P40201 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Chd1P40201 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Chd1P40201 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Chd1P40201 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms