Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rfc1P35601 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfc1P35601 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfc1P35601 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfc1P35601 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfc1P35601 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfc1P35601 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfc1P35601 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfc1P35601 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfc1P35601 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfc1P35601 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfc1P35601 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfc1P35601 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfc1P35601 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfc1P35601 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfc1P35601 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfc1P35601 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rfc1P35601 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms