Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cxcr2P35343 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cxcr2P35343 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cxcr2P35343 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cxcr2P35343 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxcr2P35343 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxcr2P35343 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxcr2P35343 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cxcr2P35343 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cxcr2P35343 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcr2P35343 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxcr2P35343 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxcr2P35343 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cxcr2P35343 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cxcr2P35343 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcr2P35343 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcr2P35343 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cxcr2P35343 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cxcr2P35343 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cxcr2P35343 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cxcr2P35343 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcr2P35343 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcr2P35343 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcr2P35343 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms