Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cd22P35329 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cd22P35329 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cd22P35329 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cd22P35329 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cd22P35329 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cd22P35329 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cd22P35329 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cd22P35329 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cd22P35329 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cd22P35329 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cd22P35329 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cd22P35329 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cd22P35329 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cd22P35329 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cd22P35329 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cd22P35329 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cd22P35329 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cd22P35329 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cd22P35329 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cd22P35329 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cd22P35329 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cd22P35329 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cd22P35329 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cd22P35329 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cd22P35329 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cd22P35329 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cd22P35329 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd22P35329 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd22P35329 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd22P35329 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd22P35329 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd22P35329 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd22P35329 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cd22P35329 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cd22P35329 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cd22P35329 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cd22P35329 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cd22P35329 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cd22P35329 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cd22P35329 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cd22P35329 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cd22P35329 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cd22P35329 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cd22P35329 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cd22P35329 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cd22P35329 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cd22P35329 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cd22P35329 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd22P35329 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd22P35329 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd22P35329 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cd22P35329 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cd22P35329 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cd22P35329 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cd22P35329 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cd22P35329 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms