Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sstr1P30873 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sstr1P30873 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sstr1P30873 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sstr1P30873 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sstr1P30873 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sstr1P30873 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sstr1P30873 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sstr1P30873 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sstr1P30873 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sstr1P30873 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sstr1P30873 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sstr1P30873 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sstr1P30873 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sstr1P30873 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sstr1P30873 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sstr1P30873 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sstr1P30873 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sstr1P30873 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sstr1P30873 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sstr1P30873 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sstr1P30873 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sstr1P30873 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sstr1P30873 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sstr1P30873 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sstr1P30873 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sstr1P30873 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sstr1P30873 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sstr1P30873 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sstr1P30873 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sstr1P30873 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sstr1P30873 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sstr1P30873 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sstr1P30873 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sstr1P30873 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sstr1P30873 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sstr1P30873 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sstr1P30873 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms