Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc6a9P28571 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc6a9P28571 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc6a9P28571 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc6a9P28571 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc6a9P28571 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc6a9P28571 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 367 ms