Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa5P28312 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa5P28312 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa5P28312 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa5P28312 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa5P28312 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa5P28312 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa5P28312 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa5P28312 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa5P28312 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa5P28312 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa5P28312 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms