Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjc1P28229 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gjc1P28229 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gjc1P28229 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gjc1P28229 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gjc1P28229 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gjc1P28229 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gjc1P28229 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gjc1P28229 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gjc1P28229 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjc1P28229 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjc1P28229 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gjc1P28229 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjc1P28229 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjc1P28229 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjc1P28229 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjc1P28229 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjc1P28229 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjc1P28229 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjc1P28229 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjc1P28229 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjc1P28229 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjc1P28229 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjc1P28229 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjc1P28229 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjc1P28229 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjc1P28229 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjc1P28229 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjc1P28229 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gjc1P28229 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjc1P28229 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjc1P28229 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjc1P28229 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjc1P28229 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms