Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pou2f1P25425 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pou2f1P25425 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou2f1P25425 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou2f1P25425 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou2f1P25425 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f1P25425 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f1P25425 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f1P25425 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f1P25425 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f1P25425 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f1P25425 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f1P25425 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f1P25425 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f1P25425 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f1P25425 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f1P25425 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou2f1P25425 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pou2f1P25425 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms