Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkchP23298 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkchP23298 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkchP23298 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkchP23298 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrkchP23298 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkchP23298 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkchP23298 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkchP23298 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkchP23298 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrkchP23298 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkchP23298 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkchP23298 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkchP23298 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkchP23298 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkchP23298 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkchP23298 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkchP23298 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkchP23298 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkchP23298 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkchP23298 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkchP23298 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkchP23298 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrkchP23298 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrkchP23298 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrkchP23298 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkchP23298 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrkchP23298 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrkchP23298 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkchP23298 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkchP23298 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkchP23298 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkchP23298 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkchP23298 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkchP23298 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkchP23298 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrkchP23298 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrkchP23298 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkchP23298 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PrkchP23298 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkchP23298 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkchP23298 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkchP23298 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkchP23298 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkchP23298 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkchP23298 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkchP23298 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkchP23298 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkchP23298 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkchP23298 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkchP23298 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkchP23298 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkchP23298 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkchP23298 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkchP23298 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrkchP23298 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PrkchP23298 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrkchP23298 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrkchP23298 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrkchP23298 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrkchP23298 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrkchP23298 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrkchP23298 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrkchP23298 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkchP23298 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkchP23298 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrkchP23298 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrkchP23298 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrkchP23298 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrkchP23298 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrkchP23298 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PrkchP23298 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms