Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp42P22227 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp42P22227 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp42P22227 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp42P22227 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp42P22227 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp42P22227 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp42P22227 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp42P22227 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp42P22227 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp42P22227 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp42P22227 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp42P22227 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp42P22227 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp42P22227 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp42P22227 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp42P22227 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zfp42P22227 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp42P22227 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp42P22227 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp42P22227 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp42P22227 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp42P22227 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp42P22227 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp42P22227 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp42P22227 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp42P22227 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp42P22227 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp42P22227 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zfp42P22227 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zfp42P22227 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp42P22227 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp42P22227 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp42P22227 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp42P22227 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp42P22227 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp42P22227 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp42P22227 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp42P22227 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp42P22227 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms