Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csn1s1P19228 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csn1s1P19228 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csn1s1P19228 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csn1s1P19228 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms