Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PcnaP17918 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PcnaP17918 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PcnaP17918 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PcnaP17918 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PcnaP17918 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PcnaP17918 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PcnaP17918 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PcnaP17918 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PcnaP17918 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PcnaP17918 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PcnaP17918 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PcnaP17918 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PcnaP17918 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PcnaP17918 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PcnaP17918 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PcnaP17918 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PcnaP17918 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PcnaP17918 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PcnaP17918 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PcnaP17918 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PcnaP17918 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PcnaP17918 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PcnaP17918 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PcnaP17918 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PcnaP17918 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PcnaP17918 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PcnaP17918 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PcnaP17918 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PcnaP17918 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PcnaP17918 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PcnaP17918 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PcnaP17918 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PcnaP17918 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PcnaP17918 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PcnaP17918 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PcnaP17918 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PcnaP17918 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PcnaP17918 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PcnaP17918 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PcnaP17918 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PcnaP17918 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PcnaP17918 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PcnaP17918 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PcnaP17918 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PcnaP17918 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PcnaP17918 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PcnaP17918 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PcnaP17918 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PcnaP17918 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms