Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata1P17679 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata1P17679 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata1P17679 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata1P17679 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata1P17679 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata1P17679 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gata1P17679 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata1P17679 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata1P17679 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gata1P17679 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata1P17679 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gata1P17679 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gata1P17679 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gata1P17679 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gata1P17679 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gata1P17679 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms