Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Defa-rs1P17533 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa-rs1P17533 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa-rs1P17533 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Defa-rs1P17533 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Defa-rs1P17533 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Defa-rs1P17533 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Defa-rs1P17533 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Defa-rs1P17533 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Defa-rs1P17533 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Defa-rs1P17533 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Defa-rs1P17533 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Defa-rs1P17533 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Defa-rs1P17533 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Defa-rs1P17533 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Defa-rs1P17533 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Defa-rs1P17533 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Defa-rs1P17533 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defa-rs1P17533 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defa-rs1P17533 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defa-rs1P17533 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defa-rs1P17533 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defa-rs1P17533 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defa-rs1P17533 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defa-rs1P17533 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Defa-rs1P17533 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Defa-rs1P17533 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defa-rs1P17533 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Defa-rs1P17533 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Defa-rs1P17533 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa-rs1P17533 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa-rs1P17533 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa-rs1P17533 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defa-rs1P17533 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa-rs1P17533 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa-rs1P17533 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defa-rs1P17533 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defa-rs1P17533 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms