Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmnb1P14733 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmnb1P14733 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmnb1P14733 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lmnb1P14733 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmnb1P14733 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmnb1P14733 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmnb1P14733 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmnb1P14733 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmnb1P14733 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lmnb1P14733 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lmnb1P14733 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lmnb1P14733 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lmnb1P14733 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmnb1P14733 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmnb1P14733 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmnb1P14733 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmnb1P14733 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmnb1P14733 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lmnb1P14733 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmnb1P14733 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmnb1P14733 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmnb1P14733 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lmnb1P14733 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmnb1P14733 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmnb1P14733 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lmnb1P14733 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lmnb1P14733 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lmnb1P14733 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Lmnb1P14733 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lmnb1P14733 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lmnb1P14733 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lmnb1P14733 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lmnb1P14733 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lmnb1P14733 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lmnb1P14733 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lmnb1P14733 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lmnb1P14733 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmnb1P14733 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmnb1P14733 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmnb1P14733 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmnb1P14733 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lmnb1P14733 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lmnb1P14733 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmnb1P14733 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmnb1P14733 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmnb1P14733 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Lmnb1P14733 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmnb1P14733 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmnb1P14733 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmnb1P14733 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmnb1P14733 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmnb1P14733 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lmnb1P14733 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lmnb1P14733 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lmnb1P14733 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lmnb1P14733 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Lmnb1P14733 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmnb1P14733 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmnb1P14733 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmnb1P14733 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmnb1P14733 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmnb1P14733 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmnb1P14733 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmnb1P14733 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmnb1P14733 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmnb1P14733 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmnb1P14733 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmnb1P14733 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lmnb1P14733 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmnb1P14733 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmnb1P14733 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmnb1P14733 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmnb1P14733 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmnb1P14733 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lmnb1P14733 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lmnb1P14733 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lmnb1P14733 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lmnb1P14733 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lmnb1P14733 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lmnb1P14733 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lmnb1P14733 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmnb1P14733 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmnb1P14733 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmnb1P14733 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms