Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vpreb2P13373 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vpreb2P13373 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vpreb2P13373 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms