Protein–RNA interactions for Protein: P10711

Tcea1, Transcription elongation factor A protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea1P10711 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcea1P10711 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcea1P10711 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcea1P10711 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcea1P10711 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcea1P10711 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcea1P10711 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcea1P10711 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcea1P10711 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcea1P10711 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcea1P10711 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcea1P10711 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcea1P10711 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcea1P10711 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcea1P10711 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcea1P10711 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcea1P10711 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcea1P10711 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcea1P10711 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcea1P10711 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcea1P10711 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcea1P10711 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcea1P10711 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcea1P10711 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcea1P10711 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcea1P10711 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms