Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P10404 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
P10404 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P10404 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P10404 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P10404 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P10404 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
P10404 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P10404 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P10404 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P10404 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P10404 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P10404 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P10404 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P10404 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P10404 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P10404 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P10404 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P10404 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P10404 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P10404 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P10404 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P10404 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P10404 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P10404 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
P10404 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P10404 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P10404 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P10404 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P10404 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P10404 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P10404 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P10404 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P10404 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P10404 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P10404 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P10404 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P10404 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P10404 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P10404 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P10404 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P10404 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P10404 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P10404 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P10404 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P10404 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P10404 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P10404 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P10404 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
P10404 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P10404 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P10404 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P10404 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P10404 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P10404 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P10404 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P10404 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P10404 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P10404 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P10404 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P10404 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
P10404 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P10404 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P10404 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
P10404 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P10404 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P10404 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P10404 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P10404 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P10404 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P10404 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P10404 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P10404 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P10404 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P10404 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
P10404 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P10404 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P10404 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P10404 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P10404 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P10404 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P10404 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P10404 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P10404 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P10404 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P10404 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P10404 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P10404 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P10404 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P10404 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P10404 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P10404 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P10404 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P10404 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P10404 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P10404 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P10404 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P10404 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P10404 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P10404 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms