Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb4P10284 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb4P10284 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb4P10284 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb4P10284 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb4P10284 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb4P10284 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb4P10284 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb4P10284 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb4P10284 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb4P10284 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb4P10284 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb4P10284 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb4P10284 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb4P10284 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb4P10284 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb4P10284 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb4P10284 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb4P10284 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb4P10284 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb4P10284 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb4P10284 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb4P10284 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb4P10284 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb4P10284 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb4P10284 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb4P10284 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb4P10284 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb4P10284 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxb4P10284 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb4P10284 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb4P10284 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms