Protein–RNA interactions for Protein: P0DN91

Tmem254c, Transmembrane protein 254c, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254cP0DN91 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem254cP0DN91 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem254cP0DN91 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem254cP0DN91 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem254cP0DN91 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms