Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem254aP0DN89 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem254aP0DN89 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem254aP0DN89 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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