Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pla2g4bP0C871 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pla2g4bP0C871 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pla2g4bP0C871 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pla2g4bP0C871 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pla2g4bP0C871 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pla2g4bP0C871 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pla2g4bP0C871 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pla2g4bP0C871 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pla2g4bP0C871 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pla2g4bP0C871 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pla2g4bP0C871 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pla2g4bP0C871 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pla2g4bP0C871 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pla2g4bP0C871 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pla2g4bP0C871 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pla2g4bP0C871 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pla2g4bP0C871 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pla2g4bP0C871 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pla2g4bP0C871 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pla2g4bP0C871 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Pla2g4bP0C871 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pla2g4bP0C871 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pla2g4bP0C871 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pla2g4bP0C871 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pla2g4bP0C871 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Pla2g4bP0C871 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pla2g4bP0C871 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pla2g4bP0C871 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms