Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmg4P0C7N9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmg4P0C7N9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmg4P0C7N9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms