Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Surf1P09925 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Surf1P09925 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Surf1P09925 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Surf1P09925 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Surf1P09925 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Surf1P09925 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Surf1P09925 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Surf1P09925 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Surf1P09925 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Surf1P09925 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Surf1P09925 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Surf1P09925 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Surf1P09925 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Surf1P09925 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Surf1P09925 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Surf1P09925 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Surf1P09925 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Surf1P09925 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Surf1P09925 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Surf1P09925 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Surf1P09925 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Surf1P09925 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Surf1P09925 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Surf1P09925 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Surf1P09925 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Surf1P09925 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Surf1P09925 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Surf1P09925 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Surf1P09925 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Surf1P09925 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Surf1P09925 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Surf1P09925 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Surf1P09925 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Surf1P09925 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Surf1P09925 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Surf1P09925 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Surf1P09925 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Surf1P09925 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Surf1P09925 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Surf1P09925 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Surf1P09925 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Surf1P09925 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Surf1P09925 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Surf1P09925 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Surf1P09925 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Surf1P09925 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Surf1P09925 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Surf1P09925 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Surf1P09925 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Surf1P09925 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Surf1P09925 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Surf1P09925 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Surf1P09925 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Surf1P09925 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Surf1P09925 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Surf1P09925 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Surf1P09925 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Surf1P09925 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Surf1P09925 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Surf1P09925 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Surf1P09925 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Surf1P09925 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Surf1P09925 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Surf1P09925 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Surf1P09925 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Surf1P09925 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Surf1P09925 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Surf1P09925 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Surf1P09925 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Surf1P09925 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Surf1P09925 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Surf1P09925 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Surf1P09925 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Surf1P09925 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Surf1P09925 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Surf1P09925 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Surf1P09925 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Surf1P09925 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Surf1P09925 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Surf1P09925 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Surf1P09925 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Surf1P09925 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Surf1P09925 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Surf1P09925 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms