Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06320 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06320 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06320 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06320 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06320 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06320 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06320 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06320 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06320 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06320 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06320 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06320 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06320 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06320 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06320 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06320 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06320 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06320 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06320 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06320 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06320 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06320 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06320 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06320 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06320 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06320 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06320 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06320 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06320 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06320 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06320 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06320 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06320 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06320 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06320 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06320 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06320 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06320 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06320 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06320 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06320 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06320 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06320 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06320 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06320 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06320 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06320 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06320 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06320 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06320 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06320 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06320 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06320 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06320 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06320 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06320 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06320 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06320 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06320 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06320 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P06320 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06320 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06320 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06320 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06320 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06320 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06320 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06320 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06320 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06320 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06320 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06320 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06320 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06320 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06320 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06320 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06320 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P06320 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P06320 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06320 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06320 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P06320 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06320 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06320 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P06320 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06320 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
P06320 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06320 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06320 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06320 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06320 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06320 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P06320 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06320 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06320 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06320 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P06320 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P06320 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P06320 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms