Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GzmbP04187 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GzmbP04187 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GzmbP04187 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GzmbP04187 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GzmbP04187 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GzmbP04187 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GzmbP04187 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GzmbP04187 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GzmbP04187 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GzmbP04187 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GzmbP04187 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GzmbP04187 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GzmbP04187 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GzmbP04187 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GzmbP04187 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GzmbP04187 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GzmbP04187 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GzmbP04187 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GzmbP04187 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GzmbP04187 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GzmbP04187 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GzmbP04187 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GzmbP04187 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GzmbP04187 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GzmbP04187 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GzmbP04187 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GzmbP04187 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GzmbP04187 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GzmbP04187 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GzmbP04187 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GzmbP04187 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GzmbP04187 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GzmbP04187 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GzmbP04187 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GzmbP04187 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GzmbP04187 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GzmbP04187 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GzmbP04187 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GzmbP04187 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GzmbP04187 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GzmbP04187 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GzmbP04187 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GzmbP04187 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GzmbP04187 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GzmbP04187 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GzmbP04187 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GzmbP04187 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GzmbP04187 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GzmbP04187 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GzmbP04187 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GzmbP04187 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmbP04187 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms