Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt10P02535 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt10P02535 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt10P02535 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt10P02535 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt10P02535 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt10P02535 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt10P02535 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt10P02535 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt10P02535 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt10P02535 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt10P02535 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt10P02535 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt10P02535 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt10P02535 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt10P02535 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt10P02535 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt10P02535 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt10P02535 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt10P02535 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt10P02535 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt10P02535 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt10P02535 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt10P02535 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt10P02535 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt10P02535 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt10P02535 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt10P02535 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt10P02535 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt10P02535 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt10P02535 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt10P02535 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt10P02535 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt10P02535 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt10P02535 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt10P02535 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt10P02535 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt10P02535 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt10P02535 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt10P02535 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt10P02535 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt10P02535 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt10P02535 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt10P02535 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt10P02535 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt10P02535 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt10P02535 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt10P02535 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt10P02535 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt10P02535 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt10P02535 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt10P02535 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt10P02535 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt10P02535 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt10P02535 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt10P02535 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt10P02535 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt10P02535 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt10P02535 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt10P02535 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt10P02535 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt10P02535 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt10P02535 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt10P02535 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt10P02535 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt10P02535 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt10P02535 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt10P02535 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt10P02535 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt10P02535 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt10P02535 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt10P02535 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt10P02535 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt10P02535 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms