Protein–RNA interactions for Protein: O88533

Ddc, Aromatic-L-amino-acid decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DdcO88533 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DdcO88533 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DdcO88533 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DdcO88533 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DdcO88533 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DdcO88533 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DdcO88533 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DdcO88533 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DdcO88533 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DdcO88533 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DdcO88533 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DdcO88533 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DdcO88533 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DdcO88533 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DdcO88533 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DdcO88533 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DdcO88533 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DdcO88533 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DdcO88533 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DdcO88533 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DdcO88533 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DdcO88533 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DdcO88533 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DdcO88533 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DdcO88533 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DdcO88533 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DdcO88533 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DdcO88533 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DdcO88533 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DdcO88533 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DdcO88533 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DdcO88533 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DdcO88533 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DdcO88533 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DdcO88533 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DdcO88533 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DdcO88533 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DdcO88533 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DdcO88533 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DdcO88533 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DdcO88533 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DdcO88533 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DdcO88533 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DdcO88533 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DdcO88533 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DdcO88533 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DdcO88533 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DdcO88533 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DdcO88533 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DdcO88533 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DdcO88533 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DdcO88533 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DdcO88533 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DdcO88533 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DdcO88533 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DdcO88533 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DdcO88533 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DdcO88533 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DdcO88533 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DdcO88533 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DdcO88533 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DdcO88533 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DdcO88533 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DdcO88533 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DdcO88533 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DdcO88533 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DdcO88533 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DdcO88533 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DdcO88533 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DdcO88533 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DdcO88533 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DdcO88533 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DdcO88533 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DdcO88533 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DdcO88533 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DdcO88533 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DdcO88533 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DdcO88533 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DdcO88533 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DdcO88533 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DdcO88533 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
DdcO88533 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DdcO88533 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DdcO88533 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DdcO88533 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DdcO88533 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DdcO88533 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DdcO88533 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DdcO88533 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DdcO88533 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DdcO88533 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DdcO88533 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DdcO88533 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DdcO88533 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DdcO88533 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DdcO88533 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DdcO88533 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DdcO88533 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DdcO88533 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DdcO88533 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms