Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clec11aO88200 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clec11aO88200 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clec11aO88200 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clec11aO88200 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clec11aO88200 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clec11aO88200 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clec11aO88200 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clec11aO88200 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Clec11aO88200 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clec11aO88200 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clec11aO88200 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Clec11aO88200 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clec11aO88200 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clec11aO88200 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Clec11aO88200 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Clec11aO88200 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Clec11aO88200 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clec11aO88200 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clec11aO88200 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clec11aO88200 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clec11aO88200 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clec11aO88200 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clec11aO88200 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clec11aO88200 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clec11aO88200 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clec11aO88200 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clec11aO88200 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clec11aO88200 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clec11aO88200 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clec11aO88200 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clec11aO88200 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clec11aO88200 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clec11aO88200 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clec11aO88200 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clec11aO88200 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clec11aO88200 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clec11aO88200 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clec11aO88200 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clec11aO88200 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clec11aO88200 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Clec11aO88200 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clec11aO88200 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clec11aO88200 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clec11aO88200 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clec11aO88200 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clec11aO88200 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clec11aO88200 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Clec11aO88200 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clec11aO88200 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clec11aO88200 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clec11aO88200 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clec11aO88200 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clec11aO88200 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clec11aO88200 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clec11aO88200 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clec11aO88200 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clec11aO88200 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clec11aO88200 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clec11aO88200 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Clec11aO88200 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Clec11aO88200 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clec11aO88200 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Clec11aO88200 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clec11aO88200 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clec11aO88200 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Clec11aO88200 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clec11aO88200 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clec11aO88200 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clec11aO88200 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clec11aO88200 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clec11aO88200 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clec11aO88200 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clec11aO88200 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Clec11aO88200 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clec11aO88200 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clec11aO88200 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clec11aO88200 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clec11aO88200 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Clec11aO88200 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clec11aO88200 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clec11aO88200 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clec11aO88200 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clec11aO88200 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Clec11aO88200 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clec11aO88200 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clec11aO88200 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms