Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CaskO70589 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CaskO70589 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CaskO70589 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CaskO70589 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CaskO70589 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CaskO70589 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CaskO70589 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CaskO70589 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CaskO70589 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CaskO70589 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CaskO70589 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CaskO70589 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CaskO70589 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CaskO70589 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CaskO70589 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaskO70589 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CaskO70589 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CaskO70589 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CaskO70589 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CaskO70589 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CaskO70589 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CaskO70589 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CaskO70589 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CaskO70589 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CaskO70589 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CaskO70589 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CaskO70589 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CaskO70589 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CaskO70589 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CaskO70589 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CaskO70589 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CaskO70589 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CaskO70589 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CaskO70589 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CaskO70589 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CaskO70589 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CaskO70589 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CaskO70589 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CaskO70589 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CaskO70589 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CaskO70589 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CaskO70589 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CaskO70589 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CaskO70589 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CaskO70589 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CaskO70589 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CaskO70589 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CaskO70589 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CaskO70589 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CaskO70589 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CaskO70589 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CaskO70589 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaskO70589 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaskO70589 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaskO70589 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CaskO70589 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CaskO70589 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CaskO70589 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CaskO70589 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CaskO70589 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CaskO70589 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CaskO70589 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CaskO70589 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CaskO70589 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CaskO70589 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CaskO70589 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CaskO70589 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CaskO70589 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CaskO70589 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CaskO70589 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CaskO70589 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CaskO70589 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CaskO70589 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CaskO70589 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CaskO70589 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CaskO70589 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CaskO70589 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CaskO70589 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CaskO70589 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CaskO70589 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CaskO70589 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CaskO70589 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CaskO70589 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CaskO70589 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaskO70589 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaskO70589 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaskO70589 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaskO70589 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaskO70589 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CaskO70589 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CaskO70589 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CaskO70589 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CaskO70589 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CaskO70589 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CaskO70589 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CaskO70589 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CaskO70589 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CaskO70589 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CaskO70589 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.3 ms